EGTOP sottolinea che il riciclo dei rifiuti organici è importante per la sostenibilità della filiera agroalimentare e che "l'economia circolare dovrebbe essere ampiamente adottata nella produzione biologica", ma sottolinea le preoccupazioni per i possibili contaminanti. Il rapporto di EGTOP sui fertilizzanti raccomanda l'approvazione della struvite e dei sali di fosfato recuperati in agricoltura biologica e fornisce anche diverse posizioni generali e specifiche sul riciclo dei nutrienti in agricoltura biologica.